医院各部门的功能、设施和人员组成情况不同，产生污水的主要部门和设施有：诊疗室、化验室、病房、洗衣房、X光照像洗印、动物房、同位素诊断、手术室等排水。医院行政管理和医务人员排放的生活污水，食堂、单身宿舍、家属宿舍排水。不同部门科室产生的污水成分和水量各不相同，如重金属废水、含油废水、洗印废水、放射性废水等。而且不同性质医院产生的污水也有很大不同。医院污水较一般生活污水排放情况复杂。
乡镇卫生院污水处理设备的选择方案原则：在筛选多种治理方案的前提下，合理选定设计方案，减少工程造价，减少建设投资，减少运行费用，主体工艺路线尽量采用自流方式，减少动力消耗，节约能源；本着切合实际，经济合理，安全适用的原则，采用成熟的工艺，增加工艺含量，完善节能措施。
乡镇卫生院污水处理设备工艺的具体思路如下：
①预处理：
首先通过格栅拦截，主要作用是去除污水中较大的悬浮或漂浮物，以减轻后续水处理工艺的处理负荷，并起到保护水泵、管道、仪表等作用。接着由提升泵定量提升至调节池进行水质水量的调节。
②二级处理：
经调节后的污水通过生物接触氧化法及MBR进行二级处理。
在生化处理系统中利用生物膜的作用使有机污染物首先转化为氨氮，同时通过好氧硝化和缺氧反硝化过程既去除有机物又去除了氨氮。生化池配以新型的高密型弹性立体填料，该填料具有负荷高、施工简易、体积小、运行稳定可靠、管理方便、维修更换方便等优点。
污水经生化处理后进入MBR膜池进行固液分离，污泥部分经污泥回流进入缺氧池进行脱氮除磷，上清液经溢流流入中间水池。
③消毒处理
污水进入消毒池，进行消毒处理，经消毒处理后能确保污水经处理后各项指标全部达标。
④污泥处理
沉淀池污泥回流后的剩余污泥经简单的浓缩消化，然后定期外运。
