医院污水特别是方舱医院污水其污水水质性质和生活污水差不多，不同就是污水内可能菌群超标，需要在污水处理设备末尾的消毒工艺上适当延长污水消毒时间，医院污水处理设备运行模式为全自动运行模式，可以去除污水当中的COD、BOD、氨氮、大肠杆菌等污染物。
为达到中出水水质要求，本污水处理工艺包含预处理（格栅、调节池）、二级处理（生化+MBR池）、消毒等环节。
加强处理效果的一级强化处理适用于处理出水进入二级处理城市污水处理厂的综合医院。二级处理工艺适用于传染病医院(包括带传染病房的综合医院)和排入自然水体的综合医院污水处理。
医院污水处理设备工艺选择原则：
1、传染病医院必须采用二级处理，并需进行预消毒处理。
2、处理出水排入自然水体的县及县以上医院必须采用二级处理。
3、处理出水排入城市下水道(下游设有二级污水处理厂)的综合医院推荐采用二级处理，对采用一级处理工艺的必须加强处理效果。
4、对于经济不发达地区的小型综合医院，条件不具备时可采用简易生化处理作为过渡处理措施，之后逐步实现二级处理或加强处理效果的一级处理。
不同处理工艺的应用情况考虑到以上原则，本方案设计的医院污水处理工艺流程进行比较，随着污水处理技术不断地发展，近年开发的在国内外普遍应用的工艺有：
1、加强处理效果的一级处理工艺 。2、二级处理工艺
